根據《國家發展改革委、鐵道部關于適當調整農用化肥鐵路運價有關問題的通知》（發改價格[2009]1722號），按照化肥價格形成機制和流通環節改革情況，為逐步理順化肥鐵路運價，決定自2009年7月1日起，適當調整鐵路化肥整車運價。
通知規定，鐵道部《鐵路貨物運價規則》（鐵運[2005]46號）附件一中貨物品類“化學肥料”（代碼1310）的整車運價號調整2號；附件二中刪除“注：整車農用化肥基價1為4.40元/噸、基價2為0.0305元/噸公里”。鐵道部《鐵路貨物運輸品名檢查表》（鐵運函[2003]278號）作相應修改。新運價變更為：基價1為6.40元/噸，基價2為0.0378元/噸公里。